液體剪切壓力：

通過將樣品從高壓腔轉入到低壓腔時產生的快速壓力落差來破碎細胞

優點：破碎快速有效,適合大體積細胞破碎

缺點：可導致樣品溫度升高（操作時需要冷卻系統）

超聲

通過高頻率的超聲波破碎細胞粉碎

優點：操作簡單

缺點：可導致樣品溫度升高,其很難通過冷卻系統降溫,剪切力有可能導致蛋白質受損,噪音較大,破碎量較小

玻璃珠磨碎

用玻璃珠的攪動來磨碎細胞

優點：對于很難破碎的細胞（如酵母）非常有用

缺點：有些慢且有噪音

滲透壓

從高滲透壓轉向低滲透壓介質

優點：操作簡便,花費低廉

缺點：僅用于外壁較脆弱的細胞（如動物細胞）

反復凍融

通過反復形成冰晶破碎細胞；通常結合酶法裂解下細胞

優點：操作簡便,花費低廉,產生大量細胞膜碎片

缺點：慢,也許會損傷敏感蛋白質或者破壞蛋白質和細胞膜的相互作用,產量低

酶法裂解

常和其他技術一同使用,如反復凍融或滲透壓破碎法；溶菌酶是破碎細菌細胞壁最常用的酶

優點：溫和,可產生較大的細胞膜碎片

缺點：慢,產量低